>W4
GTTATTGTACGAATGACTCTACTCGTTAAATAAGTCAACAAAAGGGCTGAACCAAATGAAACGTGAACAATCTCAAATGTACATGGACTGCAATACCTTTTTAGAATAAAGTTTACAGAAGTCTAAATGATTTCATCATGACAGGTGAATATGGGATCATCCAGGTCACCTCAATTAGGTGATTCTGTCTGACACTCACTGGAGGACTTATATCAGATAATCGCAATATAATCGCTCATATAATAATTGACGCTTAGATGATATCTTACCCCTTCACACTAAAGTTTCTAATGTCTGGGTGCTCACACAGACTGTGTGACCGTGTTTTGGTGTTGCTGCTAACCACATGATTCTCGAAGCTAAGTATAAGATGACTGAGAAAATTTACTGAGAAAAGTTGACCACGAAGAGAAGATCAGTAACAGTGAATGCTGGAAGAAGGAATCGAAATACCATGACTCGGTCATGGAGGCGTGGTCAACCCTCATAACTTCTTGTGTTTCGTATCAAATATATTATTCTGTCCTCAATTCGAACGTGTCCTTCTGGAGTGCTAGGTTTCATAATGCTGATTGTCATGGTACGACGAGTCAGAGTAGAATGAGATGAGATCTCCTCGTTATATCTTATATGTTATGTAGTCACATCGTGACAAATCTACAATTTAGCGATTGGGTCAATTATTCCATTAGCAACGATAAATGTACTAATATCGAACTAGACCATAATACTACAACCAAACTTTCATCAACTTGGTGTTTAAAAAGTACGTTAGACAACTAAATATTTAATCCCTGACCATAGTTTCCACATATGATAGCAGTTTAACATATGTATGTATTTCAAGCATGATGCTATTGCTGCCACCAAGTCCAGCAAGACATCCTACTTTCATATTACTAACCAATTACACTCTGTTCTGAGTAGTATTAATTTCAGTTATTTGCTAGCTTATATATATTCATTGAATTGTTTTCTCGCCTTATTCGTTTCCTAATTCTTGCCTCCATTTCATTCATTTGCAGTCTAATCCTATACTCTCGAATGCAAGAAATCAGATTACTGGCTGGAAATGTGATAGCATCTAATTCCAGCAATCTAGCTGTCCTGATATGAACGGAATTATATTGAA

>W7
TGTATTGTATTTCGAATTGAAATGGGTCACGGTAAATGGACAAACCAACCACTGTTGTACACAAGGATGTTATCCTCCAAAACTTCAACGAATTTTCACCGTTCTCAAATCAGTCGAACGTATTGTGCACAGCTTGATTACACCAATGTGAGATTGTGTGTGAAAGTGAAGTTTAGTGGTGTGTATGAAAATGTGATTAGTACTGGAATGAAGAGGTGGATGTTGAACGGACTGACTGGAGTACTCTATCACCTATTTGCTTGTTGTGACTGTCGTGCACACGAAGCACAGATTTATGAATATTGTTCATCAGACATTCAGTGCATTGTGGAAGATCACTTCGTTGATAGTGTTCAATGTCAGCTGACAGTCAACATTCGGCTCACACGTGAACATTTCACAGTTCAATCAATTGGATGATTGATTGTTCTGTATAGGGATTGACATTTCTGTACTGACCGATTTCTCACACCCTCATCTAGCGTTCTCTTCACATCCGACCAGTAACTGAATTCAATGCATTGTGTGAAGTGATGACATTCTCCACTGTATGATGAGAATTGGAGCGTTCTGGAATTGTGCGCAAATCTTGTCAGTCGGTTTCTGTGCTCGACCACATATCAAGCATTTCATCACATCTGTGTTCAGTCGTCCATAAGGAAAGTTGTCGTTGAAGCACTGGTAAATATTCCATTGTCAGTAAACACGATCCATCATTGTCTCGGCATGTCGAATGAAGTACTCGTCAAATACACTGTAGAAGCACTCGTACCACGGTGTTCAGCTATCACAGTGTATTCAATGAAGAGGGAAAACGGAGAACATATTGCAACTTCTAAACAACACCACGAGACAAATATCAAGGTGTTGAAATGTGAAGTGAAATATTGGAAATTTATATACTGCTGGAGTATTCTTTCGAAAGTAGTGATGTTTGCACGTTTATGTGAGGGATAGAGAAGTTGGTGAGTAGACTGGACTGTATTGTATTTCGAATTGA

>W9
TCTCCTCCACATCGACAGAAGCTCATGCACAATACAAGCATCACACCACTCAAACTAACTCATCACATTCTCATACAAGTCAAGCAATTCATCCACACTATCATGTGCAGTTCTCATGTAATCGCTAATTACACTCATCGTTCCGCTGAATATATACTACTCCACTATCAACCACCCACTTGTACCTCAAAACCCTACTCCACCTTCTTCCCAATCCACAAACTCGTCAAACACCTCATCCAATCCGTCAGTAATTCACATTCTCATAGTCAACTCATTTACAGGCTCACACTAATCCCTGTTCGCTCAAATCACCATACCATCACCCTACTACCACAACATCGCATCACAAACATCTGTAGCAATCCAATCGAATCAATCCCGTATCAATGTTAATAGTTGAAACACTAAACATTGAAAACTTCGCCAGCAAGAACAGAGTGAAAGGCTACACATGAAACAATACTGCAACTCAACATCTGCAACAAGACAAACAGTCAATGTATCTGACCACTGATCCCTGTTATCACACTCACCCAAACCATGTAGGTCATCTGCATCTACTGCCAGAATGGCCAACACCAACAGTCGACCACTTCATGGACCAATGCGAAGTTTTCGTTCGGCCACACCTAACTTTAAACCAACCTACATCTGTCTACACTAACGCTAAATAATCACACCGGTTGGCACACCGACATCTCACCTATCCCAAAAAGTCACGCAAATTGCTAACGGACAAACCACTTCGCGCAATCCCTGTCCACAACAACGATTCACACACTGAACAACAACAACAACAA

>W10
TCAATTGCAGTGATTGAACTGTGATGAATTGTGTGATGTAAATCTCTTCTCTCATCGTTCACTCCTCCAACATAATGTATGGGTAAATTACATGATGATGTGGTGATTGATCTGCATTATTGATGTTTGGTAGGACGCCTGCACGTATTGAAGAATGATGAATTGTGTGATGGAAATCTCCCCCAACATCATCACCCACTCGTAGAACACATTGGATTGCTGAATTACCGGTGATGTTGCGACTGAGTTTAGTGATTCTCAATTTACACATCAACTGCACAAATTGAACTGTGATGAATTGCGTGATGAAAATCTTCCTGCTCATCAATCAGTCGTCGAGCAAATTGGATGAGTGAAAGAACGGATGCTGCAGCGTTTGATATTCTATAAACTCCTTCGACAAATCAACTGAATAAATGGAACAATGTTGAATTCAGTGGAGGGAATCTCTCCTTTCTTCAGTCACAACTCAAAGGTAATGTATGAGTGAATTCACGAGCGAAGTTGCGACTGAGGTTATTGATCGAAAATCAGAGATCTCCTACACAAAATGGAAAGTGATGAATTATGTCGTGTAAATGTCATGTGACATCGTTCAATTATTGAAAATCATGTATGGGTGAATTCGTAGGTGTTGTTGTGATTGCGATAATTGATTCTAGTTTGACACATCGATTGCAGT

>W11
ATACGCCATTTATTCCCTCAACAGTTATAATCTAACACCTACACCTACAATGTTGAACATGCAGTATGTGTCTGATTTGTAAAGATTTCAATCTTCTCGTCGCTAATCACAACGACTTCAACCGATCAATCCATTTGGTCATGGGCGGCATATGACCACTGACAAATACTACGAAACGCCTGTCTTCCATTCTACGGTCAGTCAATAGAAAACTCTAATCAAACACGTAGTATCCCTGTTCAAACTATTTCACTACACCGACTGAACATTTCATAGCACGAATCAATATTCAGTAATGTTGTATTCAATAATCAATCATTTTCACTTAAATATCTGTCAGAAGAAATAACATCAATGAAACCACCATGATGCAGGG

>W3|consensus
TTGAGATCGAGAAACGCTGAAATTGTGTGTTATGCTCTTTCGGACATCAGTTTCCACGTGACATTGATGAAGTGAGACTGTGTTGAGGTCGGTCGTGTTGAAGGAAACCTAAGTGTCGGTGGAAATGCACACTGTGTGTGGTAATAGAACGAGGAAAATTACGAATGCGCCTATTGAGCTATGTTCTGCATATTGGTGTGAACAAGTGATGATCGAAGGAGCTGTGATTGTGCATGTGTATGAGTGCATAAGTCAACAAAGTTGATCACGAACAACCTGGTGAATTGACCGCATCTGTGTGATGTAGAATTAGATAATGTAGATTGTGGAGAGGTTCTACTGCTGATTGGTTGCGACGTGTCGGAAGAACATTGGGTGTGAGGCGACCAAATGTGTGTAAGGCGAATCGCGTACGCCGTCAGAACGTTGTTGTGGTGGTCTGTTTTCGGAGCTGCATCAAACTCGGAAGATAGCAAATGAGTTGTTCATCATAGTAGAGGAGTACACACGTTGGACGACCAAGTGCGTGAGCTTGCTGATGTGCAGTTTGCCGATGTCTATTCAAGTGATAAATCAGTATCAGTAGAAGACAATCATGCACAACGATTCAACAGTCAACAGCTGAAATGATGAGCCGAGTGCCGAGAATCGTTGCGCATTTCCTTAATCACTAAACAGTGAAGTGTGTGTTCACGAACGATTCCCGTTCGGTTGAGATCGAGAAACGCTGAAATTGTGTGTTATGCTCTTTCGCACATCAGTTTCCACGTAACATTGATGAAGTCA

>W6
ATTGATGACACAGAAACTTGACTCAATAGAATACTGAAAATGTCAATTCAATATATACCACACTGAAGGAAGTTGAGTTCCGTTGAAACGATTGGTAATATGAAGAAGATATTTTGTGAAGCAAAGTGTTCACTGCATATCTCATGCAAATGCTTGGTGTGAATACTGACAGCGAATGAAAAGAATTTGGCGTGTGTGATCAGCTGACATGTGGACGCGAACGATTGTAAATGAAATGGCAAAGAAATGACACACTTGAAATATGTGAAGGGAATGGTGGAGATTGTTGAGCTGTGATTGACTTGATGAA

>W12
ACAGTTTGCATTATCAATTCACACATACAATTGCAAATTCAGCAGACAATTCATTCAACACAATATTCTTCCTTCACATATATCTGTGTTTCAATGTGATGGGAATATGTTTGAGTTGAACATGATTTAGTAATTGTGATGTGCGTGATGATGCATGTGACAGGTTTGCAGTTGACGTGGATGGTGACTGTTTTGATGAGAATTGTGAGGCGGTTGTGGAGATGAGAGGTGCTGCGTACCTGTGCATTGTGGCTGGTTGGTGTT

>W5|R=564
TCATCATCATCATCATCATCATCATCATCGTTCTTGCTATATGCTGACTATGTGAAGATATGGAGAGCGATATGAAGTGAGGGTGGTAGCTGAGAACTCACAAATGACCAGAAGAAATTATCTGGATGGTTCCAAACTTGACGGGTGCTGATAAATACTTCAAGTGCTTTGTCATGCATATTCATCAACAAGGTTCACATTCATACACCATGAATAACGTTGAGCTACCTGTTGTCCAGCCACATAATGGCCTGTGAGTCATCGTTGACCAAGACGTGAGAAATACTCAAAGCTTCTGTATGATAGCCAACAAAGGTTCCACAATCTTCCAACCGTGTTGTTGTGAAAGCATTTTTAACTTTCTACATCGTGTTTGTTAGTCCAAAACTCAAATAATGCACACAGGTGGCTATCGCCTGTCCAAAATGATACAGTGAGCATTTGCAAATGTTTCATGGAACCATCACTTAGCTGATTCTCGAGATCCACAAGCTCGCGTACGATGATAGACTGGCTGAACTAATCCTATTTTCCTTGTCATAAAATAGGTGCACAAGTGACTTGATCACAGTTTCCAATTTCATTAATGATAACTTTGCATCTGACATGTCCTCATATTATTATTATTATGATTACTGTCATTATGATTATTCGTATTCTCAAACAGAATTCACGAGGACACTGAGAATTATCACATGCACAGAACAAATCACTTATCACTTCACCATCAAATCATCGAATTTTCACTCAGTGGAATCCATCATCTCACCACTCACGTGAAGCTCTGTCTGTCCACATTTTCACATCAATTTAGATCATTTGAGAGACTGGCATCGCTAGCACTAACGAAGGTCGCTCAGACTCCCGTCCTCTCCATACTCAAACCGCGTCTCCCCTCTTCAGTCTCCTCACTGCATTTCAACGTGTCACGGCTCAAGTAGCATTTCATGTAGAGTTAACTGAGTCTGTCCTATGTTTCCATTCTGATCTTGGTTCGACTTTCATGGTGTGCGCTCTCCCTTGTGATTAGTCAGAGAAACCGTCATAGGGACAGTGTTATCCCTCTCATATATAAATCACCATCCTCGTCTGGCATCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAT

>W8
ACACAATTCATCATAGTTCAAATTGTGCAATACATCTGTGAATTCAGATTCAATAAAATCGGTAACTAAATCACATATGAATTCACACATACATTATGTTCGACGAGTGAGTGATGAGAGAGGAGATTTCCATCACACAAATCCTCATAGTTCGATTTGTGCAATACATCTGTGAATTCAGACTCAATAAAATCGATAACAAATCACATATGAATTCACACATACATTATGTTCGACGAGTGGATGATGAGAGAGAGATTTCCAAC

>W13
CAATTCTCATCATCATTGTACATTCACACTCGGTGTCATCCATTGTGGCCGAATCACATTGCATTATCACATCAATTCACAGCACCATCCCATTCACTTCAACTACATTCAAACATTCTCAATCCACATCACATCCAATTCACTCCACTCAACTCCATTGCAAACAAATCAACTAAACACAAACTAAATCATTTCAACTCAACTTATTTCATCTCAACAAAACACAACTGAAGTCAAAACCAATGAAGTGAAGTGAAG

>W14
AAATATTGAAATTTTGTTCACTGAAATGAGAAGATTGTTGAGAAAAGTGAATTGGACTTCGCAAATGAAATGTAGATCATTGGACACTATGGACTGCATTCAGAATGCTTTCTGACTCGTAGTCGAACAGACATGTGAAACGGTTGGTCATTTTGAGGTTGAAATAATCAGAGCCGTATTTGTTCACTTGAAAACATGAAGATTGGTAC

>W15
AACAGATATTCACATTTACGCAATATTTTCTATTTCACACTGAAAAACAATCAACCTGATATGAAGAATCAATCCCAAGGAGTCTGTTGAGAAGTCCGTTTGCATATCACAAACTGTTGGCCCCTTTCTATCGTCTGAAGTGTATTTTGTAAAACAGTGTTTCCTTCAAGTCCCATTTCGACCTA

>W16
CAACAAGATAATCTCTATTGTGAAGATCAAATCAATAGACACTGATCAGTCATTACAATTCCATAATAATAAAGCTGTAAAATCATTTTCTCTACATTATTAATAATAAAGTGATCATCACTCACTTTATTATTTAGTCAACGTCTTTTCAGGTTGTTCAAATT

>W17
CAGTCGATCTGTACTGTTCACAGACTACCGGTTAACATCAACATATTGCGATGCCTTCACACACATGTCATTCCTTTCTTCATCTCTTCACTCATCCATTATGGCAAGTGATTGCCTGTTCGTCCTAATCATCATGATGACAGTGCAGAATGAACTGAGA

>W18
TGACCTTGTTTGCTTCCTCTGTAGCTGTATATTACACTCATGAACACTGTTGTTTTCAGCAGTTCATCATTCGAGTGTGTGTGACCGGCGTTACCATCAACAATACAATGTGAGACTGAATTCGTTCAGTCAACAATCACAGACGGTCTATTGACCAGTG

>W19
TACACATTCTCAAAATTCCTCAACCTCTCATCCACTCATCATTTCAACTGTCAAATCACTACAATCTGCACAAATCCACATACTGATTACAATCATGTGGTCACTGGTGTGTAGCTTGAACATGTAACTGTTGGAGCTG

>W20
CTGAATGTGTGCACAATGAACATGAGAGCCACACACGAGTGTGCTGCAACATCTCACTGGTCAGTAAATCCTGGCTAATCAAATCATCGAGCATGGAGCATATTGAATGCTACACGTATCTCAGTTCATTCTCCACTG

>W21
CTAGTGAACTGATCTCAGTAGAATCGTCTACGGTCGCTAAGTGAAAATAGATTGCAATGATCGTACACATTTTTGCATATACTTTTGTTTGACAGATTAGTGTTCATTATATGACGTGGTTTTCTGTACGAAATCCAG

>W22
TCTGTGTCCTTCAAATGATGCCTATTTCACTACTACAACATTCAACGTACCACATCAAATGAGACATTGAATACACGACCGATTCATTGTGCAGCCTCATTAGTTCATTTGGTGTTTGTGTAGGAGTTTCGG

>W23
AAATGCATCATCGCATTCGCTCACTGACTACTCAATACATATGTGAACTACATTTCAATTGGAAAGAAAAATAATGATATTACCACACATTTGTGCGACTATGCGCAAGTAAGCAGCACGACTCA

>W24
TGGAGAGGTTGGAAATCTGGACTATGACCAAGCAACATACTGAGTATTTCAATATTGTGGCTCATTTGCTCACTTTCATCAAAAATGAAGCATAGCAGTTCAGAGTTGAATCAAA

>W25
TGGATGCCGTCTCAGTGGTGATTGTTTTAAGTGTTCTGGTACGAGTCATGTTGTTCCTGTGTTGGAATGTGTTGAGGAGAGGAGGTGGATGCGCACTACTGAATGCGTCTCA

>W26
TTGAAATGAACATGGTTGGTTGATTGATTAGTGTTCTTGAGTTTGAGGGCTTGCGCACAAACCATTGAAATGCCGTGTTCTTATTTTGAGAGGCGGTATAGTGGAAGCGCA

>W27
AGAACTTCAGGAAATGCCTCTTCAAGCCAGTCACTGTTGAGCAAATGTTGACAGTGATGAGAAGGCGTTTCGTAGATATTATAGTAATGTTGATAGTTGAGATGATGAAT

>W28
CACTGCCTTGTGGATTACACCTCAGGTGAAAGGCTGGTGGTGTGGCCTCCTGAGAAATCCACCTGATTCGGTTCGGGCGCTCGCACTGTATTCCAGTCCTCAGACAAA

>W29
GTGAGCACTTAAACACTAGACCACTGGGTCACCATCCAACGCTCTCAATGCCTTACTTCAAACGATTCACTGAAATGACCGACACATCCACCAATGT

>W30
GTCATTCGTACAATAACAACTTATTTACATTATGCGTCAACTAAATTCCTTAACCAAGGGCGTTCATAAGGATGTTCTGAGTTGTTATCTTTTCAA

>W31
CGAAAAACATTTTCATATACGTTGGCGTAGTTTGTGGACTGGTTATATTTTGTATGTTTTGTATTGGGTTGTTAGTTGTGAGTTAGTGGCGA

>W32
ACAAGTATACAAAGGATAGTTTTCGAAAACGACTCTTAAATGATTATCCAACTGAATCAACTGTTCATTGATGAGATGAATATAATTGA

>W33
TAGTGACTTGATAGGAAGTTGTAGTGTGAGTTGTGAAGTGGTTGCAAGCATTCCTAGTCTCACAATCAGTCGATCTGTACTGTTCA

>W34
GAAAAACATTTTTATAAACAATTATGTAGTGAGTGGACGGATTTTGCTTTACATTGAGTTGCTAGTTGTGATTTAGAGGCGA

>W35
TTGGATATGTTCATCGACTGTGAGCTGTAGACTGAGACACGATACTCAACACAAACAGGGTCATAACACTGAGGCGCACT


>gi|833801|gb|U10109.1|SMU10109 Schistosoma mansoni female-specific repetitive DNA, repeat W2
AAGCTTGCTGATGTGCAGTTTGCCGATGTCTATTCAAGTGATCAATCAGTATGAGTAGAAGACAATCATG
CACAACGATTGAACAGTCAACAGCTCAAATGATGAGCCGAGTGCCGAGAATCGTTGCGCATTTCCTCAAT
CAATAAACAGTGAAGTGTGTTCACGAACGATTCCCGTTCGGTTGAGATCGGGAAACGCTGAAATTGTGTG
TTATGCTCTTTCGGACATCAGTTTCCACGTGACATTGATGAAGTGAGACTGTGTTGAGGTCGGTCGGGTT
GAAGGAAATCTAAGTGTCGGTGGAAATGCACACTGTGTGTGGTAATAGAACGACGAAAATTACGAATGCG
TCTATTGAGCTATGTTCTGCATATTGGTCTGAACAAGTGATGATCGAAGGACCTGTGATTGTGCATGTGT
ATGAGTGCATAAGTCAACAAAGTTGATAACGAACAACCTGGTGAATTGACCGCATCTGTGTGATGTACAA
TTAGATGATGTAGATTGTGGAGAGGTTCTACTGGTGATTGGTTGTGACGTGTCGGAAGAACGTTGGGTGT
CAGCCCACGAAATGTGTGTAAGGCGAAACGCGTACGCCGTCAGAACGTTGTTGTGGTGGCCTGTTTTCGG
ACCTGCATCATACTCGGAAGATAGCAAATCAGTTGTTCATCGTAGTAGAGGAGTACACACGTTGGACGAC
CAAGTGCGTAAGCTT

>gi|160956|gb|J04665.1|SCMDNAP S.mansoni female-specific DNA repeat W1
GAATTCGTTCAACACAGTGAAATTCTTCCTTCACACATATCTACCATCCAATGTCTTCGCAATATTTTGG
AGTGAAATTTGCTTTTCTCATTATATTGTGCATGATGACTGATGTGACAGGAATGAGGATTATGTTGATA
TCGTCTGAGTCAATGAGAATTGTGAATCGGATGTGCAGATGAGAGGTTGTGCATACTTGTTCCTTGTGAC
ACAAAGGAGTGGTGATGCCAGTTCGAGTGTTTGTGGATGCGATGGTGTTCACACGTGGATTGAATAAGCG
ATGAACAAATGCGATGATGCATTAGGGTGTGTGGTTGTGCTGGACCAATGTGCATAATGGAATCGTTGCT
TGTGCACATGGACCACCACAAATAACACACTCAATTCATACTCCGTCCATTTAACCATGCATTGCTTTCT
CATCAACACCACAGTTTGCATTATCATTTCGAACATTGAGTTGAATGTCGAGTGGTGAATTC

>gi|833802|gb|U12442.1|SMU12442 Schistosoma mansoni OZ.A female-specific retroposon SMAlphafem-1 repeat region
AAGCTTTATCGAGGCAATACGCACACTATGCACATATGTCAATAACACACTGATCAATTGCAGTGCTCAA
CATCAGTGAGAACATGCATGTAAACAATGCTGATTGAATTTGAACATGACCAGTTTGCACAAGTGAGTGG
CTGTGGGAAATCAGTAGGTGAGTGGATAACTTGATGGCGTTTCAGGTGAATGTTACTGTGTTCCAGTGTC
ACAGTGAACATGAACACGGGATGCAGGTACATCCAGATGGTCAGTGGCAAATCGAACGAAACACGCATCC
TGCATTCCACTGAAAACCACTATCCATCTCCCCATTAAATGCTTGTCAATTGAAGCTT