Trois parcours pré-aménagés par l'équipe pédagogique, basés sur des choix cohérents de matières optionnelles, seront proposés à partir du Semestre 3 :

1. •Parcours VersMasterBio : parcours préparant à des Masters dans le domaine de la Biologie. A l'Université de Perpignan, il est possible de poursuivre par la spécialité Master recherche.
   

2. •Parcours VersMasterEnv : parcours ouvrant vers des Masters dans le domaine de l' Environnement. L'université de Perpignan propose une spécialité Master professionnelle.
   

3. •Parcours VersMasterMEF : parcours permettant de se diriger vers les filières de préparation aux métiers de l’enseignement (Master Métiers de l'enseignement).

Un ensemble cohérent de matières optionnelles au Semestre 6 préparant à l'entrée dans la vie active (SortiePlus3), donne l’opportunité aux étudiants de se présenter dans les meilleures conditions aux concours de la fonction publique et des administrations décentralisées correspondant au domaine de compétence de la Licence BioEco : Ingénieur d'études en techniques biologiques, Technicien Supérieur Territorial en Environnement, Police Scientifique…